蔡建元（1960年-），男，汉族，福建莆田人，中共党员，1983年6月毕业于河海大学（原华东水利学院）水文系，陆地水文专业。现任水利部水文司司长，教授级高级工程师。

1995年任水利部水文司站网处处长；1998年任水利部水资源水文司水文管理处处长；2002年任水利部水文局(水利信息中心)副局长(副主任)、党委成员；2016年任水利部水文局(水利信息中心)局长(主任)、党委副书记；2017年10月任水利部水文司司长。

主持制订《中华人民共和国水文条例》及《水文监测环境和设施保护办法》、《水文站网管理办法》等部门规章，推动地方水文法规建设，构建并形成了以水文条例为龙头、部门规章为支撑、地方水文法规为基础的全国水文法规体系。组织编制印发《全国水文事业发展规划》《全国水文基础设施建设规划》等多项水利重点专项规划。组织制定实施《深化水文监测改革指导意见》，创新水文监测管理模式，推动水文监测方式和管理体制机制改革，引领水文现代化发展，大力推进新技术在水文业务中的应用，全面提升水文测报自动化水平。组织完成《全国河流湖泊基本情况普查》，项目主要成果由水利部和国家统计局《第一次全国水利普查公报》正式发布，出版《河湖基本情况普查》，填补了河流湖泊基础国情信息空白等。

作为项目负责人、主审人、主要完成人先后主持和完成多项全国性政策法规、专业规划、方案设计，以及国家级与部级科技项目、标准编制等，取得大禹奖一等奖1项，公开发表多篇学术论文。

2016年起兼任联合国教科文组织政府间国际水文计划（UNESCO-IHP）中国国家委员会主席。